Profil

A propos de moi

Issu d’un parcours en Biologie et Recherche Clinique, je me suis rapidement dirigé vers le traitement de données de santé à la fin de l’année de Master 1, en me formant en autodidacte au langage R.

Mon parcours professionnel m’a amené à travailler dans le milieu du Dispositif Médical (DM) en orthopédie, puis dans les études de vie réelle (RWD) en cancérologie.

Mes missions actuelles portent principalement sur :

• Le nettoyage et la qualification d’études RWD.

• La qualification et le requêtage d’Entrepôts de Données de Santé (bases SQL)

• Le développement d’applications Shiny ou de rapports avec Markdown/Quarto (Suivi de projets, comparaison de bases)

• Data Engineering (Automatisation de process, exécution planifiée, requêtage API)

• Enseignement :

  • Cours d’introduction à R et à la gestion de données, auprès d’étudiants de Licence 2 et Master 2 de biologie

  • Formations à R au sein de mon service

Stack technique

• Programmation :

  • Maîtrise : R, SQL

  • Notions : HTML, CSS, Python, Shell

• Bases de données :

  • MS SQL, MySQL, Oracle

• Visualisation :

  • R, Qlik Sense, Power BI

• CI/CD :

  • Git (GitHub, GitLab), Docker (en cours)

• ETL :

  • Talend

• e-CRF/EDC :

  • REDCap, EasyMedStats

• Catalogues :

  • Open Metadata

Roadmap

Les compétences que je souhaite développer dans les mois à venir, au 15 juin 2025 :

• Finaliser la maîtrise de Duckdb et Arrow pour le Big Data (Juillet 2025) ✅

• Publier une première version de ce site (Rentrée 2025) ✅

• Publier mes supports de cours dans un site Quarto (Rentrée 2025)

• Développer mes compétences CI/CD (Automne 2025)

  • Être à l’aise avec le déploiement d’applis Shiny et de documents Quarto sur différents outils de publication (GitHub Pages, Posit Connect, Shinyapps.io) ✅

  • Développer des applis Shiny Production-grade avec {rhino} et/ou {golem}, en intégrant des tests unitaires, d’intégration et End-to-End

  • Apprendre la dockerisation et déployer au moins une appli Shiny dans un docker ✅

    • Déployer cette application via un workflow dans GitHub Pages (Septembre)

• Découvrir un client Cloud (GCP/AWS/Azure) (Fin 2025)

• Me former à Databricks (Fin 2025)

• M’initier au Machine Learning (mi-2026)

  • Remise à niveau en statistiques

  • Me former à l’utilisation du package {tidymodels}